大堂
文物館大堂洋溢着濃厚的禮儀氣氛，極像中國南方鄉村的祠堂或祖先堂；中央設有中國醫藥始祖神農氏的神位。神農氏是傳統公認的中醫藥發明者，古語亦有謂「神農嚐百草」；東華供奉神農氏的傳統，是表徵東華以醫療服務起家，並堅守贈醫施藥的傳統，肩負救病拯危的重任。神位前的香案、酸枝桌椅等都是從1911年開始沿用至今。此外，大堂內外掛有不少外界送贈東華的牌匾和對聯，從內容可以略知東華三院過往的功績。
專題展覽廳
「善與人同：東華三院的慈善精神」展覽
東華三院是香港歷史最悠久、規模最龐大、服務最多元化的慈善機構。起源自東華醫院的東華三院，從一個民間慈善組織持續發展成爲現代化社會服務機構，見證香港社會發展歷程，肩負協助海外華人與家鄉保持聯繫的獨特功能。在不同的服務範疇，東華展示既堅持原則又靈活多變的以人爲本精神。正是這一份獨特的慈善精神，帶領東華迎向每一個時代的挑戰。常設展覽「善與人同：東華三院的慈善精神」展示東華如何在百多年來與香港同步成長，介紹東華自1870年創院至今，在醫療、教育、社會服務以及籌募活動方面的發展。
展廳（一）「善與人同：東華三院的慈善精神」展覽
展覽廳（二）
東華三院所保存的歷史資料相當豐富，有說是民間組織之中擁有最為完整的文獻紀錄。不少學者認為，研究東華的歷史檔案和文物可以幫助他們重塑香港，特別是香港早期華人社會的歷史。辛亥堂展覽室展示歷年來文物館建築及東華歷史檔案的保育工作，並重點介紹東華三院獨家保存的義莊文獻。
展廳（二）